加强船舶的安全管理。对停航船舶的锚泊申请严格把关，核实船舶的配员情况，检查职守人员的日常生活和工作安排、船舶关键设备的情况、应急反应计划和演习，确认特殊情况下公司能否及时派其他船员上船职守、了解公司对停航船舶的特殊管理。同时将停航船舶情况进行备案，如有必要时，做停航前安全检查，充分保证船舶处于安全状态。 　　加强停航船舶的锚泊管理。VTS中心根据船舶类型、吃水、吨位、载运情况合理分配锚位，对违反船舶锚泊规定的船舶严肃处理，并建立长期停航船舶档案。
　　加强锚地水域巡航力度。海事管理机构应制定详细的巡航计划并严格落实巡航计划，保持对停航船舶抛锚锚地的经常性巡航检查，查处并纠正违法锚泊行为和违反防污染管理规定违法排放行为，避免事故险情，确保良好的锚泊秩序和锚泊环境。
　　督促各航运企业加强停航船舶的管理。加强与船舶管理公司的沟通和协调，落实公司安全生产主体责任，督促船舶管理公司加强体系内停航船舶的安全管理，必要时可在公司和船舶安全管理体系审核时提出对停航船舶的具体要求。
　　加强水上安全信息发布工作。海事管理机构应密切关注可能出现的大风和大雾等气象动态，及时向停航船舶发布恶劣天气预警信息及相关安全信息，积极做好服务保障工作，督促停航船舶做好安全防范。
　　严查停航船舶最低职守情况。开展停航船舶最低职守情况专项检查，严查停航船舶是否按要求配备船员职守，并重点检查职守船员处置突发事件的能力和对船舶主要安全与防污染设备的操作。对未按要求配备最低职守船员的船舶要严厉处罚。
　　加大宣传力度，普及安全意识。加强对《停航船舶安全与防污染监督管理办法》的宣贯工作，同时加强对停航船舶所有人、船员的安全教育，提高其安全意识。
　　2、特别举措
　　主动服务，帮助航运企业渡过难关。要减少停航船舶数量，最根本的措施就是使航运企业渡过难关。海事管理机构应践行“三个服务”，主动帮扶航运企业，使其渡过难关。
　　划出专门供停航船舶锚泊的水域。若有条件的话，海事管理机构最好能规划出专门供停航船舶锚泊的水域。专用水域可使停航船舶锚泊相对集中，便于管理，并且不妨碍正常营运船舶的锚泊和航行，使安全度大大提高。
　　完善海事应急预案。在现有海事应急预案中加入停航船舶管理应急预案内容，针对主动停航、被动停航、事故停航等船舶分别建立应急预案，并应考虑天气、海况、防污染及安全航行等因素，整合各种应急基础信息，建立停航船舶应急管理网络，完善停航船舶应急联动机制，明确各部门的职责和责任。
　　3、被动停航船舶的管理建议
　　海事管理机构应加大对锚地船舶的巡视力度，及时发现被动停航船舶。
　　发现被动停航船舶后，立即与船东取得联系，并向其说明处理意见，请船东配合。
　　若船东不配合海事管理机构处理被动停航船舶，则海事管理机构应立即着手处理该船舶，费用由国家垫付，处理完毕后可通过法律途径向船东索要费用。